Nasceu en Nagoya, Japão. Em 1958-60, Arakawa participou em exposições e happenings neo-dadaistas e formou o grupo Neo Dadaism Organizers com mais dois artistas, afastando-se deste movimento três anos mais tarde. Desde 1961 que vive em Nova Iorque. Em 1963, juntamente com Madeline Gins apresentaram a série The Mechanism of Meaning, pinturas diagramáticas que contêm elementos emaranhados tais como palavras e símbolos, de diferentes dimensões. Em 1967, adquiriu um edifício em West Houston para fazer filmes, onde vive desde então. Em 1970, Arakawa expõe a sua obra no Pavilhão Japonês na XXXV Bienal de Veneza. Em 1973, Arakawa inicia uma experiência arquitectural em Croton, subúrbios de Nova Iorque. Em 1977, participa na "documenta 6". Arakawa recebe a condecoração Chevalier des Arts et des Lettres do Governo francês, em 1986 e o prémio da Crítica Belga em 1988e o Prémio CCA (College Art Association) em 1997. "Arakawa/Gins" apresentaram a exposição Reversible Destiny no Museu Guggenheim SoHo, Nova Iorque, em 1997.